Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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RRN3P1Q2M238 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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