Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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