Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms