Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SPCS3P61009 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SPCS3P61009 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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