Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms