Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XPAP23025 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XPAP23025 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
XPAP23025 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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