Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CXCL3P19876 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CXCL3P19876 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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