Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG7O95352 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATG7O95352 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms