Protein–RNA interactions for Protein: O75191

XYLB, Xylulose kinase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLBO75191 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XYLBO75191 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XYLBO75191 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XYLBO75191 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms