Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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