Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms