Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRNP3Q8WYN3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms