Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDCD2Q16342 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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