Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL4A6Q14031 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL4A6Q14031 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COL4A6Q14031 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms