Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms