Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms