Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDE4BQ07343 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms