Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CHRNA7P36544 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms