Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJC1P36383 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms