Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXD12P35452 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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