Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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