Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms