Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHIPQ8WWQ0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms