Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms