Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MICAL3Q7RTP6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MICAL3Q7RTP6 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms