Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDZK1Q5T2W1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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