Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TAF1AQ15573 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms