Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC8Q09428 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms