Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC073316.2-201ENST00000414126 418 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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