Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF2E1P29083 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms