Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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