Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SH3BP4Q9P0V3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SH3BP4Q9P0V3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SH3BP4Q9P0V3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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SH3BP4Q9P0V3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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