Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCNAQ96QF7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms