Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC97Q96F63 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms