Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF34Q969K3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms