Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms