Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CUL4AQ13619 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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