Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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IFT88Q13099 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFT88Q13099 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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