Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN12Q05209 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms