Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTRA4P83105 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms