Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RWDD2BP57060 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms