Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOSBP53539 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOSBP53539 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOSBP53539 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOSBP53539 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOSBP53539 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOSBP53539 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms