Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CASP4P49662 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CASP4P49662 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms