Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNGA1P29973 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms