Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRAP18433 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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