Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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