Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLKQ9UBT6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms