Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRCIN1Q9C0H9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms