Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms