Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FYCO1Q9BQS8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms